Linux 删除文件后磁盘仍满:用 df、du 和 lsof 排查 2026年10月10日 | 技术 定位 Linux 磁盘空间不足:区分数据块与 inode 耗尽,查找已删除但仍打开的文件,并验证日志句柄释放。…… 阅读全文
用 Biopython 计算蛋白质序列一致性与覆盖度 2026年10月10日 | 技术 用 Biopython 比较蛋白质局部与全局比对,明确一致性的分母,分别报告两条序列的配对残基覆盖度。…… 阅读全文
训练前用 Python 检查蛋白质嵌入文件 2026年10月10日 | 技术 用 NumPy 检查池化后的蛋白质嵌入,对照标签顺序核查样本 ID,在训练前发现重复 ID、形状错误、NaN 和无穷值。…… 阅读全文
Codex 的 bwrap loopback 报错:Ubuntu 24.04 上的 AppArmor 排查记录 2026年10月9日 | 技术 从 bwrap 的 RTM_NEWADDR 报错追到 AppArmor 权限限制,记录 Codex CLI 在 Ubuntu 24.04 上的诊断、恢复和验证过程。…… 阅读全文
蛋白质结构文件格式:PDB、mmCIF、BCIF 与 PDF 的用途 2026年10月9日 | 技术 选择 PDB、PDBx/mmCIF 与 BinaryCIF,理解 PDF 报告的用途,并用经过实测的 Python 脚本检查真实结构文件。…… 阅读全文
从 RSI 到 Google RRSI:AI 智能体如何改进自己的工作流程 2026年10月9日 | 技术 理解递归自我改进与 Google RRSI,核对候选筛选、迁移效果和成本比较,并运行不调用模型的本地演示。…… 阅读全文
用 SQLite 保存 Python 批处理进度,中断后接着运行 2026年10月9日 | 技术 用 SQLite 逐条保存结果,重启后跳过已完成任务,并通过输入指纹避免复用过期结果。附可运行的 Python 示例。…… 阅读全文
Python 大型 CSV 随机抽样:用固定种子实现蓄水池算法 2026年10月8日 | 技术 用 Python 标准库一次扫描 CSV,保留表头并随机抽取完整记录,控制内存占用,记录随机种子以便复现。…… 阅读全文
RFOptimization 实用指南:蛋白质设计优化、环境搭建与结果检查 2026年10月8日 | 技术 理解 RFOptimization 优化流程,配置 RF3、Boltz 与 MPNN,分别验证模型分支,并用 Python 检查已完成的优化循环。…… 阅读全文
FlashPPI 使用指南:蛋白质相互作用检索、接触评分与结果检查 2026年10月8日 | 技术 理解 FlashPPI 的候选检索和接触评分流程,核查计算复杂度与输出行为,并检查单蛋白质组预测报告。…… 阅读全文
OmegaTherm 使用指南:蛋白质突变稳定性预测与输入检查 2026年10月8日 | 技术 理解 OmegaTherm 的 ΔΔG 与 ΔTm 输出,区分在线与本地接口,准备经过校验的突变输入,并核查本地推理所需权重。…… 阅读全文
用 Python 和 SQLite 检查 CSV 中的重复 ID 2026年10月8日 | 技术 逐条读取 CSV,用临时 SQLite 索引统计重复样本 ID、出现次数与记录位置,避免在 Python 集合中保存全部 ID。…… 阅读全文